背景
從1918年到1920年，迄今為止已知的最大規模的甲型流感病毒（IAV）大流行在全球範圍內傳播，造成2000萬至1億人死亡。曆史記錄捕捉到了疾病動態的關鍵方面，如大流行浪潮的發生和嚴重程度。然而，其他重要信息，如允許病毒適應新宿主的突變，只能從IAV基因組中獲得。對疫情期間收集並仍保存在曆史病理學收藏中的標本進行分析，可以大大有助於更好地了解其過程。然而，需要有效的RNA處理方案來處理此類標本。
結果
在這裏，我們描述了一種有效的古代RNA測序的替代方案，並評估了其在曆史樣本上的性能，包括已發表的陽性對照。無酚/氯仿方案有效地恢複了古老的病毒RNA，特別是小片段，並通過基於連接的方法結合片段來保持RNA片段方向性的信息。其中一個評估的曆史樣本允許從瑞士恢複第一個1918年的IAV基因組。該基因組來源於瑞士第一波疫情初期死亡的患者，已經包含與人類適應相關的突變。
結論
我們介紹了一種從福爾馬林固定的濕標本中回收古RNA的替代高效工作流程。我們還展示了來自歐洲的第一個精確測定日期和完整的流感基因組，強調了1918年歐洲疫情第一波期間與人類適應相關的突變的早期發生。