高致病性禽流感（HPAI）病毒的2.3.4.4b分支在世界各地的野生和家禽中爆發，繼續在美國各地的奶牛、家禽和其他動物中傳播。自4月以來，美國疾病控制與預防中心通過基因組序列分析確認了67例人類病例。其中三例，在實驗室測試中發現氨基酸替代NA-S247N可能會略微降低對神經氨酸酶抑制劑奧司他韋的敏感性。美國疾病控制與預防中心還發現，從加利福尼亞州最近確診的H5N1禽流感病例中采集的病毒聚合酶酸性（PA）蛋白發生了不同的變化。
目前的疫情證實了高致病性禽流感病毒的不可預測性，因為奶牛的接觸途徑和病毒傳播方式仍然未知。在生牛奶中發現了高濃度的病毒RNA。奶牛場和家禽場的幾種動物以及越來越多的農場工人受到影響。美國農業部動植物衛生檢驗局的數據顯示，受感染奶牛、其他動物和農場工人體內的病毒密切相關。到目前為止，只有一名農場工人發現了哺乳動物適應標志物（E627K），幾乎所有農場工人都出現了輕微的眼部症狀和呼吸道症狀。盡管EpiFlu上已經提供了1000多個來自此次疫情的基因組，但缺乏及時共享從農場動物收集的可操作數據仍然是一個令人擔憂的問題。
2025年1月26日，美國農業部公布了2025年收集的首批奶牛病例的遺傳數據。此前，美國農業部分享了華盛頓野生動物保護區死亡動物的數據，以及基因簇和基因型B3.13相同的貓寵物食品樣本的數據。
2025年1月10日，美國疾病控制與預防中心公布了加利福尼亞州另一例人類病例的樣本數據。此前，他們公布了美國第一例人類感染H5N1禽流感死亡病例的數據，該病例為路易斯安那州一名接觸過非商業後院家禽和野鳥的患者。美國疾病控制與預防中心還公布了從愛荷華州和威斯康星州接觸過受感染商業家禽的農場工人收集的病毒樣本數據，與在華盛頓州的人類病例和加拿大卑詩省的一例嚴重人類病例感染了在家禽和野鳥中檢測到相同的D1.1基因型。基於代表性子樣本的最新遺傳樹分析日期為2025年1月26日。