為進一步分析禽流感病毒(AIV)H5N2分離株血凝素(HA)基因的特性,參照已發表H5亞型禽流感HA基因序列設計了1對引物,采用RT-PCR技術,以禽流感病毒A/Ostrich/Denmark/72420/96(D96)RNA為模板,擴增了HA全基因並進行核苷酸同源性比較,氨基酸編碼分析,繪制系統發育進化樹。結果表明,擴增片段長1737個核苷酸,包含了完整的HA基因的開放閱讀框架,與Genbank已發表的H5N1和H5N2分離株的HA基因序列比較,發現與國內H5N1分離株同源性較低,只有80%左右,而與H5N2各株序列具有很高的同源性,最高達97.5%,印證了AIV基因組8個片段間頻繁的重組及AIV高變異性的特點。推導的氨基酸序列分析表明,HA蛋白裂解位點上遊丟失了4個連續堿性氨基酸(R-R-R-K),裂解位點處氨基酸序列為E-T-R,僅包含一個堿性氨基酸(R-)殘基,符合低致病性毒株的特征,證明為低致病性毒株。其HA推導後氨基酸序列與H5N1AIV的同源性接近90%,以其研究的疫苗,可以有效抵禦我國流行的H5亞型AIV病毒的感染,同時因為是弱毒株,以其研制的疫苗具有更好的...

禽流感病毒AOstrichDenmark7242096_LPAI_H_5N_2_株HA全基因克隆與序列分析.pdf