H9與H5亞型禽流感病毒血凝素基因的快速鑒別

建立一步法RT-PCR檢測方法,對禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)的血凝素(Hemagglutinin,HA)分型進行了研究。參照AIV的HA基因序列設計1對引物,對H9和H5亞型AIV進行了擴增,産物大小分別爲579bp和177bp。經測試,該引物不與新城疫病毒等雞的其它傳染性病原及雞肌肉組織的核酸發生交叉反應。敏感性分析發現,從50pg的AIV總RNA中亦能擴增到目的條帶。結果表明,此次利用1對引物建立的一步法RT-PCR方法簡便適用,可以在一次反應中同時將H9和H5亞型AIV進行快速檢測和分型。另外,兩個亞型的擴增産物均包含了HA裂解位點在內的基因序列,可通過測序推導氨基酸順序以預測H5或H9亞型禽流感病毒的潛在毒力。
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