Harrington WN, Eure K, Hurt T, Webby RJ, Kercher L. 從城市公園中一只常駐加拿大鵝中分離出與D1.1相關的重配HPAI H5N1病毒. J Virol 0:e00860-26
發表人:kickingbird 發表時間:2026年11月5日8点57分 來源:J Virol 0:e00860-26
自2021年底引入北美以來,2.3.4.4b高致病性禽流感(HPAI)H5Nx病毒已成為地方性病毒,並與共流的低致病性禽流感病毒(LPAI)廣泛重組,產生了多樣的基因型和表型。2024年初,新穎的D1.1重配種在北太平洋遷徙路線出現,並與多種人類H5N1感染相關,到12月成為北美HPAI的主導基因型。盡管水禽是禽流感病毒的天然宿主,但研究主要集中在鴨類。鵝類研究相對不足,部分原因是LPAI的曆史性較低的流行率,盡管在2024年D1.1浪潮中占HPAI陽性樣本的40.3%。全年生活在人類附近非遷徙鵝的HPAI動態特征尤其薄弱。
2025年11月1日,一名公民觀察者報告稱,美國田納西州孟菲斯市一個城市公園湖中,一只懶散的加拿大鵝(Branta canadensis)表現出頭部傾斜。第二天,這只鳥被發現死亡。腿帶1298-09581確認其為一只四年前綁紮的成年雌性,時間為2021年7月2日,距離回收地點約兩英裏,支持其為當地常住種群成員。公園內沒有其他鴨子或鵝同時受到影響。
在1毫升病毒運輸培養基中采集了泄殖腔、口咽和氣管拭子及腦組織。按照制造商說明,使用RNeasy(Qiagen)提取RNA,並利用基質和H5特異性實時逆轉錄定量PCR篩選,使用先前描述的引物和探針;Cq為<35的樣本被視為陽性。為進行病毒分離,每個樣本均按照世界衛生組織指南接種到10至11天齡的胚胎雞蛋中,四個雞蛋均檢測到傳染病毒。拭子材料也提交給美國農業部(USDA)國家獸醫服務實驗室以確認HPAI(GCA_054696965.1,EPI_ISL_20336767)。
全基因組Illumina測序鑒定出一個2.3.4.4b型H5N1病毒。對四個解剖位點共識基因組的比較顯示,八個片段中有六個完全相同:只有一個非同義替換(PB1)和一個同義替換(HA)位點被區分開來。該病毒使用美國農業部基因流感(USDA genoFLU)基因分型為Minor124。在全球共享所有流感數據倡議(GISAID)數據庫中,僅識別出另外六例Minor124檢測,均來自太平洋西北地區,這表明遷徙路徑上存在監測空白,將推定駐鳥與遷徙水禽的檢測聯系起來。全基因組序列按片段串接,使用MAFFT v7.526比對,最大似然系統發育則通過IQ-TREE v3.1.1推斷,結合ModelFinder模型選擇和1000次超快速引導複制。Minor124與同期的D1.1病毒在七個片段中聚集,而其NP(97.6%與D1.1 NP的同一性)則聚集在美國農業部指定的am17譜系內,支持與D1.1相關的重配。
雖然這只是更廣泛監測行動中的一個孤立個體,但它從一個人流量大的城市公園中被推測為常駐鵝的發現中被發現,這一點值得關注。常駐加拿大雁可能作為候鳥與人類相關環境之間的橋梁,通過與人和共享空間的反複密切接觸,促進本地生存和環境汙染。這些發現支持將常駐水禽納入HPAI監測和溢出風險評估,尤其是在城市和郊區環境中。
2025年11月1日,一名公民觀察者報告稱,美國田納西州孟菲斯市一個城市公園湖中,一只懶散的加拿大鵝(Branta canadensis)表現出頭部傾斜。第二天,這只鳥被發現死亡。腿帶1298-09581確認其為一只四年前綁紮的成年雌性,時間為2021年7月2日,距離回收地點約兩英裏,支持其為當地常住種群成員。公園內沒有其他鴨子或鵝同時受到影響。
在1毫升病毒運輸培養基中采集了泄殖腔、口咽和氣管拭子及腦組織。按照制造商說明,使用RNeasy(Qiagen)提取RNA,並利用基質和H5特異性實時逆轉錄定量PCR篩選,使用先前描述的引物和探針;Cq為<35的樣本被視為陽性。為進行病毒分離,每個樣本均按照世界衛生組織指南接種到10至11天齡的胚胎雞蛋中,四個雞蛋均檢測到傳染病毒。拭子材料也提交給美國農業部(USDA)國家獸醫服務實驗室以確認HPAI(GCA_054696965.1,EPI_ISL_20336767)。
全基因組Illumina測序鑒定出一個2.3.4.4b型H5N1病毒。對四個解剖位點共識基因組的比較顯示,八個片段中有六個完全相同:只有一個非同義替換(PB1)和一個同義替換(HA)位點被區分開來。該病毒使用美國農業部基因流感(USDA genoFLU)基因分型為Minor124。在全球共享所有流感數據倡議(GISAID)數據庫中,僅識別出另外六例Minor124檢測,均來自太平洋西北地區,這表明遷徙路徑上存在監測空白,將推定駐鳥與遷徙水禽的檢測聯系起來。全基因組序列按片段串接,使用MAFFT v7.526比對,最大似然系統發育則通過IQ-TREE v3.1.1推斷,結合ModelFinder模型選擇和1000次超快速引導複制。Minor124與同期的D1.1病毒在七個片段中聚集,而其NP(97.6%與D1.1 NP的同一性)則聚集在美國農業部指定的am17譜系內,支持與D1.1相關的重配。
雖然這只是更廣泛監測行動中的一個孤立個體,但它從一個人流量大的城市公園中被推測為常駐鵝的發現中被發現,這一點值得關注。常駐加拿大雁可能作為候鳥與人類相關環境之間的橋梁,通過與人和共享空間的反複密切接觸,促進本地生存和環境汙染。這些發現支持將常駐水禽納入HPAI監測和溢出風險評估,尤其是在城市和郊區環境中。
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