甲型禽流感病毒與哺乳動物持續傳播相關的基因組特征

相對較少的甲型流感病毒譜系在哺乳動物中進化出長期持續傳播。原因至今仍大多未知,鳥類IAV進化出持續哺乳動物傳播的可能性仍是一個持續關注的問題。我們通過生物信息學分析測量了115,520個IAV全基因組中GC二核苷酸的GC含量和頻率。我們發現,持久哺乳動物譜系的GC相關含量呈下降趨勢,且可可靠地與僅在鳥類及偶爾感染哺乳動物的IAV區分。同樣,最早的持久哺乳動物譜系病毒顯示GC相關含量降低,表明這一特征可能部分促成了它們最終的持續存在。最近在水貂、狐狸和人類體內傳播的高度致病性2.3.4.4b H5病毒也表現出GC相關含量的降低。雖然不足,但GC相關含量的降低可能是哺乳動物持續傳播的必要條件,應納入流感大流行風險評估工具中。