自2023年以來，高致病性禽流感（HPAI）H5N1進化枝2.3.4.4b在南大洋迅速擴張，導致南極下野生動物大量死亡。然而，由於監測限制，它對南極洲的滲透以及對依賴冰的物種的影響仍然沒有得到很好的解決。我們報告了在南極冰依賴性海豹（食蟹海豹；Lobodon carcinophaga）中首次確認的H5N1感染，並記錄了2024年11月至12月期間威德爾海北部食蟹海豹的死亡率。結合9個物種的基因組，血清學和觀察數據，我們在食蟹海豹和海帶鷗（Larus dominicanus）中檢測到H5N1 RNA，並從兩者中回收了完整的HA，NA和M2基因序列。系統發育分析使我們能夠確定至少兩次將高致病性禽流感H5N1進化枝2.3.4.4b獨立引入南極半島北部地區。血清學提供了強有力的證據，證明先前曾接觸過食腐鳥類，但在企鵝或鳍足類動物中未檢測到H5免疫力。總之，這些結果表明，正在進行的新型病毒入侵南極洲，可能是由海上過程（例如浮冰上的動物相互作用）促成的，而這些過程對於陸基監測來說仍然是不可見的。這些發現突出了依賴冰的鳍足類動物對高致病性禽流感H5N1進化枝2.3.4.4b的脆弱性，以及迫切需要擴大南極綜合監測框架，將血清學，機會性屍體采樣和基因組測序結合起來。