2024年，高致病性的禽流感A型H5N1在美國引發了野生鳥類、家禽、奶牛及其他哺乳動物的爆發，CDC還報告了61例人類病例。此前，在德克薩斯州和北卡羅來納州的下水道棚及附近受影響的奶牛群中，已報告檢測到A型流感A型H5 RNA，此前乳牛出現後。在這裏，我們對廢水中總流感A型和H5血凝素基因進行了回顧性檢測，並在2023年9月至2024年5月期間，加州城市汙水處理區的呼吸道病毒季節內，提出並應用新的H1和H3基因檢測方法。甲型、H1型和H3型流感均被定期檢測，H5首次檢測於三月。我們開發了一個模型，利用蒙特卡洛模擬和先前發布的參數，估算汙染人群、家禽、野生鳥類或受H5汙染牛奶的數量，這些數量是達到廢水中H5濃度所需的。我們的發現表明，在加州的汙水處理區，受汙染的牛奶或受感染的家禽是廢水中H5最可能的來源。我們創建了一個公開工具，用於將H5輸入模型應用於其他汙水流棚，以估算所需輸入量。