高致病性禽流感（HPAI）A/H5N1，演化系2.3.4.4b，已全球傳播，首例爆發於2025年巴西一家商業家禽養殖場。本研究旨在利用全基因組下一代測序（NGS）對巴西多個地區的A/H5N1樣本進行基因特征描述，以研究病毒多樣性和重組事件。系統發育分析顯示，巴西分離株分為兩個不同的類群：一種與2025年阿根廷檢測到的病毒高度相似，表明新重配種沿南美區域傳播路徑適應;以及與北美分離株的另一個聚類，表明是獨立引入的。基因分型證實了南美洲此前未報道的基因組重排現象的出現，凸顯了該地區病毒進化的複雜性。這些發現凸顯了疫情期間基因組多樣性，並強化了持續深入分子監測以監測A/H5N1對動物和公共健康動態及潛在影響的必要性。