甲型流感病毒（IAV）具有廣泛的禽類和哺乳動物宿主，導致疾病爆發，並增加了泛動物和大流行的風險。進化枝2.3.4.4b的H5N1亞型正在引起目前的高致病性禽流感（HPAI）泛動物。環境變化加劇了高致病性禽流感H5N1在全球野生動物中的傳播，偶爾會發生從海鳥到鯨類的溢出事件。采樣困難和可用於診斷的有限測試是鯨目病毒學研究的挑戰。了解鯨類高致病性禽流感爆發的風險需要對IAV感染事件進行全面檢查。記錄的病例與IAV亞型H1N3，H13N2，H13N9和H5N1有關，並且在太平洋，大西洋和北冰洋采樣的鯨類中已有報道。從鯨目動物中分離出的H5N1 IAV數量正在增加，並影響了牙鲆亞目飛燕科和Phocoenidae科的六種宿主物種。對21株H5N1鯨目動物分離株中40種病毒適應哺乳動物的分子標記的分析表明，三種病毒蛋白中存在突變：血凝素（HA），聚合酶堿性蛋白2（PB2）和核蛋白（NP）。從鯨目動物中分離出的HA和PB2序列以及海鳥和海洋哺乳動物中共同發生的病例的系統發育分析不支持病毒在鯨目動物之間的持續傳播。在海鳥和其他海洋哺乳動物的擴散之後，IAV H5N1似乎正在感染鯨類動物。增加對鯨類IAV感染的全球監測至關重要，因為這些海洋哺乳動物是人類大流行防範的哨兵物種，也是海洋生物多樣性保護和生態系統健康的關鍵物種。