高致病性禽流感病毒H5N1自2024年初首次侵入奶牛以來，一直在感染美國的奶牛群。盡管國家戰略旨在檢測受影響的牛群，但監測H5N1病毒牛群的最佳方法尚未得到正式研究，我們也不了解牛群層面的感染模式。為了了解奶牛群中H5N1隨時間變化的感染模式，我們在 2024年秋季的一項觀察性研究中對加利福尼亞州未受影響的農場進行了早期監測。從每個牛群提交每日散裝罐裝牛奶（BTM）樣本，並通過rRt-PCR檢測甲型流感（IAV）。在一部分牛群中，在檢測到BTM後不久，還完成了對不同類別牛的多種排泄類型和圍欄級日奶的IAV檢測。BTM每天檢測到IAV至少持續33天，一些牛群在75天窗口後繼續檢測到。BTM Ct 最低點在檢測1-3周之間可見。在接受測試的牛群中，在BTM檢測後或開始圍欄采樣之前，在所有牛欄的牛奶中檢測到病毒。在檢測到BTM後不久收集的奶牛樣本中，IAV檢測呈陽性的比例非常低（2.8%），盡管在所有排泄類型中都發現了該病毒，但大多數陽性樣本來自牛奶。這表明BTM可能是牛群感染的最佳早期指標，並且病毒在牛群入侵後向所有泌乳牛欄的移動速度相對較快。這些結果還表明，BTM檢測日間隔較長的監測策略可能會錯過感染窗口較短的牛群。由於大多數牛群經曆了測試日，一些提交的BTM樣本檢測到病毒，而另一些則沒有，並且當牛群的BTM檢測呈陰性時，在圍欄牛奶樣本中檢測到病毒，因此這項工作還強調了研究IAV rRt-PCR檢測在聚合牛奶樣本中的測試靈敏度的必要性。