與其內部基因提供者H9N2禽流感病毒（AIV）相比，新興的早期人畜共患禽H7N9和H3N8低致病性禽流感病毒（LPAIV）在人類中的致病性顯著增強，表明表面HA或NA的關鍵作用。在這裏，我們生成了幾種結合HA，NA或HA的重配AIV?+?來自具有內部H9N2 AIV基因的新興人畜共患H7N9或H3N8 LPAIV的NA，並研究了HA和NA對人類細胞和小鼠中重配體複制和致病性的影響。通過分析受體結合，病毒吸附，HA切割效率，病毒內吞作用和出芽來確定關鍵的受影響階段。我們發現感染了含有早期人畜共患H7N9 LPAIV HA而非NA的病毒的小鼠表現出高死亡率，體重減輕，嚴重的肺損傷和肺部病毒載量增加。我們發現HA替代增強了人A549細胞中的病毒複制，並顯示出雙重唾液酸受體結合能力。這種替代還促進了病毒與哺乳動物細胞的附著，並通過提高HA0切割效率促進了內吞作用；然而，萌芽沒有受到影響。此外，來自新出現的人畜共患H3N8 LPAIV的HA提高了小鼠重配的致病性。總之，我們的研究表明，新出現的人畜共患LPAIV的HA通過增加病毒進入並引起肺損傷而導致哺乳動物的高致病性，從而突出了具有雙受體結合特性和HA切割效率的HA作為未來新出現的人畜共患AIV風險評估的新標志物。