2024年初，美國多個州的奶牛中出現了H5N1高致病性禽流感病毒（HPAIV）進化枝2.3.4.4b，這標志著該病毒的宿主範圍和流行病學特征發生了重大變化。傳統上僅限於鳥類，目前在牛（一種以前不被認為易受傷害的哺乳動物宿主）中檢測到H5N1病毒，引起了動物和人類對人畜共患病和哺乳動物適應的迫切關注。我們評估了使用市售巴氏殺菌牛奶作為前哨基質進行H5N1 HPAIV分子檢測和遺傳表征的可行性。我們的目的是確定零售牛奶是否可以作為病毒學監測的實用工具，並評估使用全長基因組片段擴增從這個高度處理的基質中提取基因組序列信息。我們的結果將商店購買的牛奶中的HPAIV序列與牛爆發聯系起來，並強調零售牛奶作為監測窗口的潛力和局限性。總之，這些發現提供了證據，表明可以在零售牛奶中以與特定供應鏈相關的模式反複檢測到甲型流感病毒RNA，基因組數據證實了與牛中傳播的病毒的密切關系。