自2014年首次出現以來,特別是自2020年以來,高致病性禽流感病毒(HPAIV)H5分支2.3.4.4b在全球家禽和野鳥中引發了嚴重的疫情,尤其在歐洲和北美地區頻繁爆發。2022年10月,哥倫比亞首次報告了南美洲的疫情,隨後其他南美國家也出現了禽類、野鳥、哺乳動物甚至人類的感染。本研究對南美洲分離出的HPAIV H5N1 2.3.4.4b病毒的血凝素(HA)基因進行了系統發育和突變分析,以研究其進化、傳播和人畜共患病的潛力。分析結果顯示,2022年4月至6月期間,病毒的有效種群數量有所增加,隨後南美洲出現了多次H5N1病毒爆發。此外,病毒變種起源於一個最近的共同祖先,估計存在於2017年6月。HA基因的平均進化率為6.95×10^-3次替換每位點每年。HA序列分析發現了一個突變(D171N),位於抗體結合位點和病毒聚合界面,這可能與免疫逃逸和新宿主感染有關。此外,與疫苗株A/chicken/Ghana/AVL763/2021相比,南美毒株具有L104M、T156A、P181S和V210A四個替換位點。理解病毒進化和傳播的動力學對於制定有效預防策略以減輕未來疫情至關重要。