2024年，美國奶牛中爆發了一種新型的H5N1禽流感。由於監測數據有限，確定疫情的真實規模變得困難。我們提出了一種隨機元種群傳播模型，模擬H5N1流感通過個體奶牛在美國大陸35,974個牛群中的傳播。根據州際獸醫檢驗證書數據，傳播是通過牛群之間的移動實現的。我們估計了各州的漏報率，並提出了奶牛在出口點檢測陽性率隨時間的預期變化。我們研究了幹預措施對潛在流行病學動態的影響，證明了當前的幹預措施影響不足，僅平均阻止了175.2次報告疫情。我們的模型預測，截至2025年1月，大部分疾病負擔集中在西海岸各州。我們量化了疫情規模的不確定性，突出了最緊迫需要捕捉的數據流，並指出了預計會看到疫情爆發的州，其中亞利桑那州和威斯康星州風險最大。我們的模型表明，奶牛疫情將在2025年繼續發生，並需要更緊急的、以農場為中心的生物安全幹預措施和有針對性的監測方案。