背景
活禽市場（LPM）中禽流感病毒（AIV）的流行和傳播是一個嚴重的公共衛生問題。本研究旨在調查LPM環境中不同亞型禽流感病毒的流行情況，並分析糞便，汙水，飲用水飼，養籠和砧板中A型H5，H7和H9亞型核酸陽性率（NAPR）的差異和季節性。
方法
2019-2023年期間，從中國南方和北方的活禽市場收集了糞便，飼養籠拭子，飲用水，汙水和砧板拭子。實時PCR用於篩選病毒亞型。分離病毒，並進行深度測序以獲得全基因組序列。卡方檢驗用於分類變量的統計分析，GraphPad Prism軟件用於構建圖形。
結果
2019年至2023年間，中國南方和北方的活禽市場共采集了64599份環境樣本。華南地區A型平均NAPR顯著高於華北地區（P<0.05). 華南地區五種環境樣品攜帶的H5、H7和H9亞型的NAPR差異顯著（P<0.05),砧板（10.84%），飼養籠（0.28%）和飲用水（40.97%）的NAPR較高。H9和H5亞型的平均NAPR表現出季節性，在中國南方的1月和2月達到峰值，而H9亞型的峰值在中國北方的10月至2月。共鑒定出19種亞型。H5亞型顯著降低，H7亞型幾乎檢測不到，其他亞型（例如H3亞型）增加。
結論
自2022年以來，高致病性H5亞型在中國活禽市場中顯著減少。然而，一些亞型的比例有所增加，例如對禽類致病性較低的H3亞型，而H9亞型仍然保持在高水平。必須指出的是，這些低致病性禽流感病毒通常沒有明顯症狀，可以在感染的禽類中無症狀傳播，但對人類具有高致病性。我們的研究結果為禽流感病毒的控制和預防提供了見解，並指出了活禽市場中禽流感病毒引發大流行的風險。