大約在2005年，甲型流感病毒（IAV）再次跨越物種障礙，在犬類群體中建立了穩定的譜系。目前，禽源H3N2犬流感病毒（CIV）是唯一在犬群中穩定傳播的流感毒株。最初，這種病毒僅在中國和韓國等亞洲國家被檢測到。然而，在2015年，它在美國被從狗身上分離出來，隨後在那裏引發了大規模疫情。自最初分離以來，H3N2 CIV已被證明具有感染哺乳動物（包括貓）的能力。在整個傳播過程中，該病毒不斷增強了對哺乳動物宿主的適應性，構成了潛在的公共衛生威脅。為了監測H3N2 CIV在中國的流行情況，我們在2023年12月至2024年2月期間在北京、長春、沈陽、呼和浩特和雲浮收集了131份有呼吸道症狀的狗和貓的鼻拭子。從這些樣本中，成功分離出一種流感病毒株。通過全基因組測序和系統發育分析，該菌株被鑒定為禽源H3N2 CIV。所有八個基因片段都表現出氨基酸替換，PB2 107 R N、HA1 202I和M1 227T位置與目前流行的H3N2人流感病毒（HuIV）中的位置相同。有趣的是，到2021年左右，H3N2 HuIV已經完成了PB2 107-N的替代。我們的研究表明，H3N2 CIV正朝著增強對哺乳動物宿主的適應性方向發展，強調了加強監測和風險評估的必要性。