背景 盡管加強了控制措施，但全球家禽養殖場和野鳥仍持續爆發高致病性禽流感。它導致鳥類種群前所未有的死亡率，並越來越多地影響哺乳動物物種。為了有針對性地預防和控制疾病，需要更好地了解高致病性禽流感進入農場的途徑。有人提出了空氣傳播的相關性，但涉及空氣采樣的研究有限，缺乏關於傳播途徑的明確證據。
目的 通過真核生物DNA測序對宿主材料進行表征，研究野鳥高致病性禽流感病毒是否可以通過進氣口進入家禽舍。
方法 我們收集了三個受高致病性禽流感影響的家禽養殖場及其周圍的顆粒物樣本，這些養殖場在采樣前進行了清理和淨化。室內測量（n=61）直接在通過進氣口進入的氣流中進行，而室外空氣樣本（n=60）則在禽舍周圍收集。從鳥類康複收容所獲得了陽性對照。我們通過對18S rRNA基因擴增子進行深度測序，對環境DNA進行了元條形碼編碼。
結果 我們在所有三個家禽養殖場內和兩個家禽養殖場外的空氣中檢測到水鳥DNA。在物種層面注釋的序列包括天鵝和簇絨鴨。水鳥DNA存在於鳥類收容所的所有室內和室外空氣樣本中。
結論 受汙染野鳥的空氣傳播物質可能通過進氣口將高致病性禽流感病毒引入家禽飼養場。eDNA元條形碼可以通過檢測宿主來評估高致病性禽流感病毒和其他可能通過空氣傳播的病原體的生物安全漏洞。