卫生署疾病管制局於5月20日接获某医院通知，一名住中部之20岁女性轻微肺炎病患之呼吸道检体分离出无法次分型之A型流感病毒，经该局进一步检验并进行基因定序為H6N1流感病毒。经调查个案密切接触者36名，其中4人有类流感症状，经检验均未发现H6N1流感病毒感染，该局将持续加强监测。
    疾病管制局指出，这名女性係在一早餐店工作，未曾出国，也未有相关禽鸟接触史，5月5日出现发烧、咳嗽、头痛及肌肉痠痛等症状后，5月8日凌晨因持续发烧及呼吸急促而就医住院治疗，经X光检查显示有轻微肺炎，在投予流感抗病毒药物后症状好转，於5月11日出院，目前已康復。5月7日採自病患之呼吸道检体分离出H6N1病毒，5月24日病患血清检体H6N1抗体HI titer為1:20，6月8日採集之血清则為1:40。该局除对採集之呼吸道检体进行流感病毒检验外，亦针对呼吸道感染常见之病毒例如腺病毒、呼吸道融合病毒、冠状病毒、肠病毒及鼻病毒等23种进行检测，均呈阴性反应。农政单位亦自病例住家周围1公里内2家养禽场家禽採集检体检验，结果未检出H6N1禽流感病毒。
    该局自1999年起，除对法定传染病（流感併发症）病患监测检验外，也经常性对社区类流感病患及住院之不明原因肺炎病患採集检体进行流感病毒检验，系统性地监测国内流感病毒活动情形及临床实际状况。检验之检体件数每年约1至2万件，至今累计超过25万件，鑑定与分离的流感病毒约86,000株，除今（102）年检出1株境外移入H7N9禽流感病毒外，未曾自人体检体中检出包括H6N1在内的其他非H1、H3亚型A型流感病毒。
    本案经邀集农政单位及相关医学与兽医专家召开会议讨论，依上述现有流行病学调查结果研判，本案是以轻微肺炎表现之散发个案，无证据显示有人传人现象，卫生及农政单位亦将持续加强人类、禽鸟与环境之监测。
    H6N1為普遍存在家禽间的低病原性禽流感病毒，全球未曾发现人类感染病例。本次由病患所分离之病毒基因序列显示属禽源性，与本土家禽H6N1病毒株最為接近，对克流感及瑞乐沙等抗病毒药物敏感。
    疾管局呼吁，预防禽流感病毒感染，禽畜相关从业人员应做好个人防护措施，民眾应避免与禽畜动物有不必要的接触，同时应勤洗手、食用完全煮熟的禽肉和蛋类，以降低感染的风险。此外，如出现类流感或结膜炎等症状，应戴口罩儘速就医，并主动告知医师禽畜工作史及禽鸟接触史。