为了解H9N2和H5N1亚型流行性感冒病毒株的NS1基因特性，采用RT—PCR方法测定了12株2000～2003年间在华南地区分离的禽流感病毒株的NS1基因核苷酸序列，测序显示6株H9N2亚型流感病毒NS1基因开放阅读框(ORF)长654．bp，编码217个氨基酸，6株H5N1亚型毒株，NS1基因ORF长678bp，编码225个氨基酸，核苷酸和氨基酸同源性分析表明，同一亚型分离株之间有很高的同源性，而不同亚型的H9N2和H5N1毒株之间存在较大差异，BLAST分析表明，H5N1和H9N2亚型流感病毒分离株的NS1基因分别与近两年从香港特区和华南地区的鸭中分离的毒株A／DucE／Hong Kong／646．3／01(H5N1)、A／Duck／Shantou／2143／01(H9N2)有很高的亲缘关系，该研究结果为进一步进行NS1功能研究奠定了基础。
southchinaNS1-04.rar