季节性流感的控制面临疫苗有效性差异和非药物干预（NPI）效果不确定的挑战。尽管疫苗接种仍然是主要策略，但其有效性在疫苗匹配和不匹配的流感季之间有所不同。COVID-19 大流行后，NPI 接受度的提高增强了流感控制的可行性，但最佳组合策略仍知之甚少。我们使用基于个体的模型分析了香港六个流感季（2009-2013）中具有不同流行特征的流感传播情况。我们整合监测、血清学和学校缺勤数据进行校准，从而能够准确估计已报告和未报告的感染情况。我们评估了针对特定年龄群的疫苗接种、病时居家、佩戴口罩及基于学校的干预措施在不同真实场景下的效果。与基线相比，儿童疫苗接种在各项策略中始终表现最佳，其中针对12岁以下儿童的接种可实现人口层面发病率的最大降低（每10万人接种相对减少可达8.5%）。在非药物干预措施中，40%的口罩覆盖率可将发病率降低18%–43%，与25%的症状个体居家隔离效果相当。在疫苗匹配不理想的季节，高覆盖率口罩使用与居家隔离相结合可将发病率降低79%–84%。高覆盖率的校内疫苗接种比停课更有效，可将学生发病率降低高达85%，而14天停课仅能降低33%。我们的多来源校准方法为优先儿童疫苗接种及策略性非药物干预组合提供了稳健的证据。