自2024年初首次感染奶牛以来，高致病性禽流感病毒H5N1已在美国奶牛群中持续传播。尽管国家策略旨在本次疫情中监测受影响牛群，但关于纵向牛群层面病毒检测的信息尚未进行正式研究。为了解H5N1在受感染奶牛群中随时间推移的乳汁病毒排泄情况，我们于2024年秋季和冬季对加州奶牛场开展了疫情调查。本次观察性调查的主要目标是确认这些加州牛群的H5N1初始感染，并通过纵向批量乳池奶（BTM）检测评估病毒分布。次要目标是评估通过纵向乳头水平乳汁（PLM）采样评估病毒传播情况，研究对象为部分受影响畜群。来自19个最初未感染、但作为单一兽医诊所客户并自愿参与本研究的畜群，每日提交鼻拭子样本（BTM）。采用逆转录聚合酶链式反应（rRT-PCR）检测流感病毒A型（IAV）。在其中5个畜群中，于初次BTM IAV检测后不久即完成每日PLM IAV检测。总计提交4,749份BTM样本和2,922份PLM样本进行检测，最终所有畜群均感染IAV。在初步检测后，BTM每天都会检测到IAV，持续时间至少为33天，一些畜群在采样期结束时（>75天）仍会继续检测到。首次检测后1-3周出现BTM-Ct最低值。在PLM测试的牛群中，BTM检测后不久，在所有牛栏的样本中都检测到了病毒，在某些情况下，PLM采样的第一天，在所有牛栏中都发现了病毒。总体而言，这些结果支持BTM检测作为乳制品H5N1疫情的有效早期检测工具，但表明，不在手术中检测所有泌乳奶牛的聚集乳，或BTM检测日之间间隔较长的监测策略可能无法识别所有受影响的牛群。未来的研究应研究与某些畜群长期病毒检测相关的农场因素，并评估用于聚集牛奶样本的IAV rRT-PCR检测的灵敏度。