甲型禽流感病毒与哺乳动物持续传播相关的基因组特征

相对较少的甲型流感病毒谱系在哺乳动物中进化出长期持续传播。原因至今仍大多未知,鸟类IAV进化出持续哺乳动物传播的可能性仍是一个持续关注的问题。我们通过生物信息学分析测量了115,520个IAV全基因组中GC二核苷酸的GC含量和频率。我们发现,持久哺乳动物谱系的GC相关含量呈下降趋势,且可可靠地与仅在鸟类及偶尔感染哺乳动物的IAV区分。同样,最早的持久哺乳动物谱系病毒显示GC相关含量降低,表明这一特征可能部分促成了它们最终的持续存在。最近在水貂、狐狸和人类体内传播的高度致病性2.3.4.4b H5病毒也表现出GC相关含量的降低。虽然不足,但GC相关含量的降低可能是哺乳动物持续传播的必要条件,应纳入流感大流行风险评估工具中。