进化枝2.3.4.4b的高致病性禽流感（HPAI）病毒通过与共同传播的低致病性禽流感（LPAI）病毒的重配继续多样化，并通过迁徙飞行路线反复引入韩国。在2025年10月的国家野生鸟类监测期间，在韩国西南部的普通水鸭中检测到两种不同亚型的高致病性禽流感病毒H5N1和H5N9。全基因组测序证实两种分离株均为属于G2c亚谱系的进化枝2.3.4.4b病毒。系统发育分析表明，H5N1病毒具有与2022-2023年季节在韩国流行的22G4基因型相关的基因组骨架，其中包含源自LPAI病毒的PB1片段。H5N9病毒代表了一种独特的重配，携带与H11N9 LPAI病毒密切相关的NA基因以及与同一季节流行的KorD和KorC基因型相关的内部片段。贝叶斯时间尺度分析表明，这两种分离株均起源于2019年左右具有共同祖先的东亚H5Nx谱系，并且H5N1病毒在2023年末与密切相关的中国毒株分离。这两种病毒都含有多种哺乳动物适应标记，包括在最近的东亚高致病性禽流感病毒株中常见的替代物。这些发现表明，区域HPAI和LPAI基因库之间正在进行谱系间重组，强调了迁徙水禽在将新兴变异引入韩国方面的持续作用。对遗传上不同的重配的早期检测突出了持续的野生鸟类监测，快速基因组表征和国际数据共享的重要性，以跟踪新出现的高致病性禽流感谱系的进化和传播。