禽流感H5N1(2.3.4.4b)病毒引发了全球范围内的动物流行,且意外地在奶牛中爆发了广泛的疫情,因此构成了大流行威胁。为了制定控制策略,关键在于确定适应牛细胞的潜力是H5N1病毒的普遍特征,还是特异于2.3.4.4b类群的病毒,或仅限于该类群内的某些基因型。利用代表>60年H5N1历史的重组病毒及其他IAV进行比较,我们证明牛细胞的复制适应度在2.3.4.4b基因型间差异很大,(ii)在该演化群全球扩展之前的病毒中具有限制,(iii)由内部基因盒决定,(iv)不限于乳房上皮细胞。PB2聚合酶亚基的突变成为适应的关键决定因素,尽管其表型效应依赖于具体情境。牛B3.13及部分鸟类基因型表现出牛干扰素诱导抗病毒反应的增强调节,这一点至少由PB2、核蛋白和非结构蛋白NS1决定。我们的结果凸显了IAV宿主范围的多基因特性,并揭示了牛细胞的复制适应度及其可能对牛的适应潜力,在H5N1病毒的进化轨迹中变化显着。