寻求通用流感疫苗对于减轻全球流感相关发病率和死亡率的负担具有很大的希望。然而，在鉴定能够引发强大而持久的免疫应答的保守表位方面仍然存在挑战。在这项研究中，我们通过使用计算，生物化学和生物物理技术，探讨了1968年至今聚糖进化对H3血凝素的影响及其对蛋白质结构，抗原性和免疫原性的影响。通过冷冻电子显微镜对HK/68和Sing/16的结构表征表明，虽然HK/68对酶促去糖基化具有抗性，但聚糖的去除会破坏Sing/16中高糖基化的头部和膜近端区域的稳定性。此外，Sing/16血凝素头部结构域中聚糖的出现改变了疫苗接种后的多克隆免疫应答，以靶向酯酶和茎。这些见解扩展了我们对聚糖的理解，超出了它们在蛋白质折叠中的作用，并突出了聚糖整合和免疫识别之间的相互作用，以设计通用流感疫苗。