2024年，高致病性的禽流感A型H5N1在美国引发了野生鸟类、家禽、奶牛及其他哺乳动物的爆发，CDC还报告了61例人类病例。此前，在德克萨斯州和北卡罗来纳州的下水道棚及附近受影响的奶牛群中，已报告检测到A型流感A型H5 RNA，此前乳牛出现后。在这里，我们对废水中总流感A型和H5血凝素基因进行了回顾性检测，并在2023年9月至2024年5月期间，加州城市污水处理区的呼吸道病毒季节内，提出并应用新的H1和H3基因检测方法。甲型、H1型和H3型流感均被定期检测，H5首次检测于三月。我们开发了一个模型，利用蒙特卡洛模拟和先前发布的参数，估算污染人群、家禽、野生鸟类或受H5污染牛奶的数量，这些数量是达到废水中H5浓度所需的。我们的发现表明，在加州的污水处理区，受污染的牛奶或受感染的家禽是废水中H5最可能的来源。我们创建了一个公开工具，用于将H5输入模型应用于其他污水流棚，以估算所需输入量。