高致病性禽流感（HPAI）A/H5N1，演化系2.3.4.4b，已全球传播，首例爆发于2025年巴西一家商业家禽养殖场。本研究旨在利用全基因组下一代测序（NGS）对巴西多个地区的A/H5N1样本进行基因特征描述，以研究病毒多样性和重组事件。系统发育分析显示，巴西分离株分为两个不同的类群：一种与2025年阿根廷检测到的病毒高度相似，表明新重配种沿南美区域传播路径适应;以及与北美分离株的另一个聚类，表明是独立引入的。基因分型证实了南美洲此前未报道的基因组重排现象的出现，凸显了该地区病毒进化的复杂性。这些发现凸显了疫情期间基因组多样性，并强化了持续深入分子监测以监测A/H5N1对动物和公共健康动态及潜在影响的必要性。