甲型流感病毒（IAV）具有广泛的禽类和哺乳动物宿主，导致疾病爆发，并增加了泛动物和大流行的风险。进化枝2.3.4.4b的H5N1亚型正在引起目前的高致病性禽流感（HPAI）泛动物。环境变化加剧了高致病性禽流感H5N1在全球野生动物中的传播，偶尔会发生从海鸟到鲸类的溢出事件。采样困难和可用于诊断的有限测试是鲸目病毒学研究的挑战。了解鲸类高致病性禽流感爆发的风险需要对IAV感染事件进行全面检查。记录的病例与IAV亚型H1N3，H13N2，H13N9和H5N1有关，并且在太平洋，大西洋和北冰洋采样的鲸类中已有报道。从鲸目动物中分离出的H5N1 IAV数量正在增加，并影响了牙鲆亚目飞燕科和Phocoenidae科的六种宿主物种。对21株H5N1鲸目动物分离株中40种病毒适应哺乳动物的分子标记的分析表明，三种病毒蛋白中存在突变：血凝素（HA），聚合酶碱性蛋白2（PB2）和核蛋白（NP）。从鲸目动物中分离出的HA和PB2序列以及海鸟和海洋哺乳动物中共同发生的病例的系统发育分析不支持病毒在鲸目动物之间的持续传播。在海鸟和其他海洋哺乳动物的扩散之后，IAV H5N1似乎正在感染鲸类动物。增加对鲸类IAV感染的全球监测至关重要，因为这些海洋哺乳动物是人类大流行防范的哨兵物种，也是海洋生物多样性保护和生态系统健康的关键物种。