甲型猪流感病毒（SWIAV）是一种重要的人畜共患病原体，有可能引起人类流感大流行。猪被认为是产生新型重配甲型流感病毒的“混合容器”。2009年，一种猪源重配病毒（2009年H1N1大流行，pdm/09 H1N1）扩散到人类，导致全球流感大流行。这种病毒很快扩散回猪群，并与流行的瑞士病毒重新分配。我们之前曾报道，自2016年以来，携带pdm/09和三重重配（TR）衍生内部基因的基因型4（G4）重配欧亚禽类（EA）H1N1病毒在中国猪群中占主导地位，对养猪业和公共卫生构成威胁。在这里，我们正在进行的监测证实，从2019年到2023年，G4 EA H1N1病毒仍然是中国主要的swIAV，并与H3N2病毒等共同传播的swIAV进行了重组，以产生新的重配EA H1N2病毒。遗传分析显示，G4 EA H1N1病毒的pdm/09衍生内部基因起源于2009-2010年pdm/09 H1N1和EA H1N1病毒之间的重配，并在猪宿主中经历了独立和持续的进化，表现出比那些更高的进化率。在人类中流行的pdm/09 H1N1病毒。内部基因的加速进化增强了哺乳动物细胞中G4 EA H1N1病毒的聚合酶活性，导致小鼠中病毒复制和致病性增加。这项研究为猪促进甲型流感病毒的遗传进化提供了证据，并强调需要增加对猪中新型重配病毒的关注。重要的是，pdm/09 H1N1病毒的出现突出了甲型猪流感病毒（swIAVs）在产生具有大流行潜力的新型流感病毒中的作用。自2009年以来，pdm/09 H1N1病毒经常传播到猪身上，并与循环中的swIAV进行重组，在全球范围内产生了许多携带pdm/09衍生基因的新重配病毒。携带pdm/09衍生的内部基因并获得增加的人类感染性的G4 EA H1N1病毒在2019年至2023年期间仍然是中国的主要swIAV，并与共循环swIAV重新分配以产生新的亚型病毒。G4 EA H1N1病毒的内部基因在2009-2010年期间起源于人类pdm/09 H1N1病毒，并且表现出比人类宿主更高的进化率和更大的遗传多样性。这有助于增加哺乳动物的病毒适应和致病性。因此，持续的监测和免疫工作对于控制新出现的重配SWIAV和保护公众健康至关重要。