南美洲高致病性禽流感病毒H5分支2.3.4.4b的血凝素基因系统发育与突变分析

自2014年首次出现以来,特别是自2020年以来,高致病性禽流感病毒(HPAIV)H5分支2.3.4.4b在全球家禽和野鸟中引发了严重的疫情,尤其在欧洲和北美地区频繁爆发。2022年10月,哥伦比亚首次报告了南美洲的疫情,随后其他南美国家也出现了禽类、野鸟、哺乳动物甚至人类的感染。本研究对南美洲分离出的HPAIV H5N1 2.3.4.4b病毒的血凝素(HA)基因进行了系统发育和突变分析,以研究其进化、传播和人畜共患病的潜力。分析结果显示,2022年4月至6月期间,病毒的有效种群数量有所增加,随后南美洲出现了多次H5N1病毒爆发。此外,病毒变种起源于一个最近的共同祖先,估计存在于2017年6月。HA基因的平均进化率为6.95×10^-3次替换每位点每年。HA序列分析发现了一个突变(D171N),位于抗体结合位点和病毒聚合界面,这可能与免疫逃逸和新宿主感染有关。此外,与疫苗株A/chicken/Ghana/AVL763/2021相比,南美毒株具有L104M、T156A、P181S和V210A四个替换位点。理解病毒进化和传播的动力学对于制定有效预防策略以减轻未来疫情至关重要。