背景
活禽市场（LPM）中禽流感病毒（AIV）的流行和传播是一个严重的公共卫生问题。本研究旨在调查LPM环境中不同亚型禽流感病毒的流行情况，并分析粪便，污水，饮用水饲，养笼和砧板中A型H5，H7和H9亚型核酸阳性率（NAPR）的差异和季节性。
方法
2019-2023年期间，从中国南方和北方的活禽市场收集了粪便，饲养笼拭子，饮用水，污水和砧板拭子。实时PCR用于筛选病毒亚型。分离病毒，并进行深度测序以获得全基因组序列。卡方检验用于分类变量的统计分析，GraphPad Prism软件用于构建图形。
结果
2019年至2023年间，中国南方和北方的活禽市场共采集了64599份环境样本。华南地区A型平均NAPR显着高于华北地区（P<0.05). 华南地区五种环境样品携带的H5、H7和H9亚型的NAPR差异显着（P<0.05),砧板（10.84%），饲养笼（0.28%）和饮用水（40.97%）的NAPR较高。H9和H5亚型的平均NAPR表现出季节性，在中国南方的1月和2月达到峰值，而H9亚型的峰值在中国北方的10月至2月。共鉴定出19种亚型。H5亚型显着降低，H7亚型几乎检测不到，其他亚型（例如H3亚型）增加。
结论
自2022年以来，高致病性H5亚型在中国活禽市场中显着减少。然而，一些亚型的比例有所增加，例如对禽类致病性较低的H3亚型，而H9亚型仍然保持在高水平。必须指出的是，这些低致病性禽流感病毒通常没有明显症状，可以在感染的禽类中无症状传播，但对人类具有高致病性。我们的研究结果为禽流感病毒的控制和预防提供了见解，并指出了活禽市场中禽流感病毒引发大流行的风险。