Edoardo Giussani, Alessandro Sartori, Angela Salom. FluMut:高致病性H5N1基因组突变监测工具. Virus Evolution, 2025; veaf011
发表人:kickingbird 发表时间:2025年3月13日21点27分 来源:Virus Evolution, 2025; veaf011
在过去的一个世纪里,甲型流感病毒(IAV)导致了五次报告的流行病中的四次,所有这些流行病都源于具有禽类基因组片段的病毒。最近高致病性禽流感(HPAI)病毒的传播,特别是分支2.3.4.4b A(H5N1)亚型,导致哺乳动物感染率惊人增加,引发了人们对未来流行病可能性的担忧。为此,我们开发了FluMut,这是一种开源的跨平台工具,旨在识别对H5N1病毒表型有潜在影响的分子标记。FluMut利用最新的数据库FluMutDB快速分析数千个核苷酸序列,识别与宿主适应、毒力增加和抗病毒耐药性相关的突变。该工具既有命令行界面,也有用户友好的图形界面,使具有不同计算专业知识水平的研究人员都可以访问它。FluMut提供全面的输出,包括检测到的标记物表、其生物学效应和相应的文献参考。该工具填补了高致病性禽流感H5N1基因组监测中的一个关键空白,促进了对病毒进化的实时监测,并有助于识别可能预示大流行潜力增加的突变。未来的更新将把FluMut的功能扩展到其他流感亚型。
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